Evidence of Novel Susceptibility Variants for Prostate Cancer and a Multiancestry Polygenic Risk Score Associated with Aggressive Disease in Men of African Ancestry - Université de Rennes Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue European Urology Année : 2023

Evidence of Novel Susceptibility Variants for Prostate Cancer and a Multiancestry Polygenic Risk Score Associated with Aggressive Disease in Men of African Ancestry

Fei Chen (1, 2) , Ravi Madduri , Alex Rodriguez , Burcu Darst , Alisha Chou , Xin Sheng , Anqi Wang , Jiayi Shen , Edward Saunders , Suhn Rhie , Jeannette Bensen , Sue Ingles , Rick Kittles , Sara Strom , Benjamin Rybicki , Barbara Nemesure , William Isaacs , Janet Stanford , Wei Zheng , Maureen Sanderson , Esther John , Jong Park , Jianfeng Xu , Ying Wang , Sonja Berndt , Chad Huff , Edward Yeboah , Yao Tettey , Joseph Lachance , Wei Tang , Christopher Rentsch , Kelly Cho , Benjamin Mcmahon , Richard Biritwum , Andrew Adjei , Evelyn Tay , Ann Truelove , Shelley Niwa , Thomas Sellers , Kosj Yamoah , Adam Murphy , Dana Crawford , Alpa Patel , William Bush , Melinda Aldrich , Olivier Cussenot (3) , Gyorgy Petrovics , Jennifer Cullen , Christine Neslund-Dudas , Mariana Stern , Zsofia Kote-Jarai , Koveela Govindasami , Michael Cook , Anand Chokkalingam , Ann Hsing , Phyllis Goodman , Thomas Hoffmann , Bettina Drake , Jennifer Hu , Jacob Keaton , Jacklyn Hellwege , Peter Clark , Mohamed Jalloh , Serigne Gueye , Lamine Niang , Olufemi Ogunbiyi , Michael Idowu , Olufemi Popoola , Akindele Adebiyi , Oseremen Aisuodionoe-Shadrach , Hafees Ajibola , Mustapha Jamda , Olabode Oluwole , Maxwell Nwegbu , Ben Adusei , Sunny Mante , Afua Darkwa-Abrahams , James Mensah , Halimatou Diop , Stephen van den Eeden , Pascal Blanchet (4, 5) , Jay Fowke , Graham Casey , Anselm Hennis , Alexander Lubwama , Ian Thompson , Robin Leach , Douglas Easton , Michael Preuss , Ruth Loos , Susan Gundell , Peggy Wan , James Mohler , Elizabeth Fontham , Gary Smith , Jack Taylor , Shiv Srivastava , Rosaline Eeles , John Carpten , Adam Kibel , Luc Multigner (4) , Marie-Élise Parent , Florence Menegaux (6) , Geraldine Cancel-Tassin , Eric Klein , Caroline Andrews , Timothy Rebbeck , Laurent Brureau , Stefan Ambs , Todd Edwards , Stephen Watya , Stephen Chanock , John Witte , William Blot , J. Michael Gaziano , Amy Justice , David Conti , Christopher Haiman (1, 2)
Ravi Madduri
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Alex Rodriguez
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Burcu Darst
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Alisha Chou
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Xin Sheng
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Anqi Wang
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Jiayi Shen
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Edward Saunders
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Suhn Rhie
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Jeannette Bensen
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Sue Ingles
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Rick Kittles
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Sara Strom
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Benjamin Rybicki
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Barbara Nemesure
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William Isaacs
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Janet Stanford
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Wei Zheng
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Maureen Sanderson
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Esther John
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Jong Park
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Jianfeng Xu
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Ying Wang
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Sonja Berndt
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Chad Huff
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Edward Yeboah
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Yao Tettey
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Joseph Lachance
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Wei Tang
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Christopher Rentsch
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Kelly Cho
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Benjamin Mcmahon
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Richard Biritwum
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Andrew Adjei
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Evelyn Tay
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Ann Truelove
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Shelley Niwa
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Thomas Sellers
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Kosj Yamoah
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Adam Murphy
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Dana Crawford
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Alpa Patel
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William Bush
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Melinda Aldrich
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Gyorgy Petrovics
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Jennifer Cullen
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Christine Neslund-Dudas
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Mariana Stern
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Zsofia Kote-Jarai
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Koveela Govindasami
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Michael Cook
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Anand Chokkalingam
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Ann Hsing
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Phyllis Goodman
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Thomas Hoffmann
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Bettina Drake
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Jennifer Hu
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Jacob Keaton
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Peter Clark
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Mohamed Jalloh
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Serigne Gueye
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Lamine Niang
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Olufemi Ogunbiyi
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Michael Idowu
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Olufemi Popoola
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Akindele Adebiyi
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Oseremen Aisuodionoe-Shadrach
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Hafees Ajibola
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Mustapha Jamda
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Olabode Oluwole
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Maxwell Nwegbu
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Ben Adusei
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Sunny Mante
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Afua Darkwa-Abrahams
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James Mensah
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Halimatou Diop
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Stephen van den Eeden
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Jay Fowke
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Graham Casey
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Anselm Hennis
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Alexander Lubwama
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James Mohler
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Elizabeth Fontham
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Shiv Srivastava
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Rosaline Eeles
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John Carpten
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Adam Kibel
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Marie-Élise Parent
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Geraldine Cancel-Tassin
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Eric Klein
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Caroline Andrews
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Timothy Rebbeck
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Laurent Brureau
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Stefan Ambs
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Todd Edwards
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Stephen Watya
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Stephen Chanock
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John Witte
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William Blot
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J. Michael Gaziano
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Amy Justice
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David Conti
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Résumé

Background: Genetic factors play an important role in prostate cancer (PCa) susceptibility.Objective: To discover common genetic variants contributing to the risk of PCa in men of African ancestry.Design, setting, and participants: We conducted a meta-analysis of ten genome-wide association studies consisting of 19378 cases and 61620 controls of African ancestry.Outcome measurements and statistical analysis: Common genotyped and imputed variants were tested for their association with PCa risk. Novel susceptibility loci were identified and incorporated into a multiancestry polygenic risk score (PRS). The PRS was evaluated for associations with PCa risk and disease aggressiveness.Results and limitations: Nine novel susceptibility loci for PCa were identified, of which seven were only found or substantially more common in men of African ancestry, including an African-specific stop-gain variant in the prostate-specific gene anoctamin 7 (ANO7). A multiancestry PRS of 278 risk variants conferred strong associations with PCa risk in African ancestry studies (odds ratios [ORs] >3 and >5 for men in the top PRS decile and percentile, respectively). More importantly, compared with men in the 40-60% PRS category, men in the top PRS decile had a significantly higher risk of aggressive PCa (OR = 1.23, 95% confidence interval = 1.10-1.38, p = 4.4 × 10-4).Conclusions: This study demonstrates the importance of large-scale genetic studies in men of African ancestry for a better understanding of PCa susceptibility in this high-risk population and suggests a potential clinical utility of PRS in differentiating between the risks of developing aggressive and nonaggressive disease in men of African ancestry.Patient summary: In this large genetic study in men of African ancestry, we discovered nine novel prostate cancer (PCa) risk variants. We also showed that a multiancestry polygenic risk score was effective in stratifying PCa risk, and was able to differentiate risk of aggressive and nonaggressive disease.
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Dates et versions

hal-04164446 , version 1 (18-07-2023)

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Citer

Fei Chen, Ravi Madduri, Alex Rodriguez, Burcu Darst, Alisha Chou, et al.. Evidence of Novel Susceptibility Variants for Prostate Cancer and a Multiancestry Polygenic Risk Score Associated with Aggressive Disease in Men of African Ancestry. European Urology, 2023, 84 (1), pp.13-21. ⟨10.1016/j.eururo.2023.01.022⟩. ⟨hal-04164446⟩
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