Evidence of Novel Susceptibility Variants for Prostate Cancer and a Multiancestry Polygenic Risk Score Associated with Aggressive Disease in Men of African Ancestry
Fei Chen
(1, 2)
,
Ravi Madduri
,
Alex Rodriguez
,
Burcu Darst
,
Alisha Chou
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Xin Sheng
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Anqi Wang
,
Jiayi Shen
,
Edward Saunders
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Suhn Rhie
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Jeannette Bensen
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Sue Ingles
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Rick Kittles
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Sara Strom
,
Benjamin Rybicki
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Barbara Nemesure
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William Isaacs
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Janet Stanford
,
Wei Zheng
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Maureen Sanderson
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Esther John
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Jong Park
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Jianfeng Xu
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Ying Wang
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Sonja Berndt
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Chad Huff
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Edward Yeboah
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Yao Tettey
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Joseph Lachance
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Wei Tang
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Christopher Rentsch
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Kelly Cho
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Benjamin Mcmahon
,
Richard Biritwum
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Andrew Adjei
,
Evelyn Tay
,
Ann Truelove
,
Shelley Niwa
,
Thomas Sellers
,
Kosj Yamoah
,
Adam Murphy
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Dana Crawford
,
Alpa Patel
,
William Bush
,
Melinda Aldrich
,
Olivier Cussenot
(3)
,
Gyorgy Petrovics
,
Jennifer Cullen
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Christine Neslund-Dudas
,
Mariana Stern
,
Zsofia Kote-Jarai
,
Koveela Govindasami
,
Michael Cook
,
Anand Chokkalingam
,
Ann Hsing
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Phyllis Goodman
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Thomas Hoffmann
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Bettina Drake
,
Jennifer Hu
,
Jacob Keaton
,
Jacklyn Hellwege
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Peter Clark
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Mohamed Jalloh
,
Serigne Gueye
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Lamine Niang
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Olufemi Ogunbiyi
,
Michael Idowu
,
Olufemi Popoola
,
Akindele Adebiyi
,
Oseremen Aisuodionoe-Shadrach
,
Hafees Ajibola
,
Mustapha Jamda
,
Olabode Oluwole
,
Maxwell Nwegbu
,
Ben Adusei
,
Sunny Mante
,
Afua Darkwa-Abrahams
,
James Mensah
,
Halimatou Diop
,
Stephen van den Eeden
,
Pascal Blanchet
(4, 5)
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Jay Fowke
,
Graham Casey
,
Anselm Hennis
,
Alexander Lubwama
,
Ian Thompson
,
Robin Leach
,
Douglas Easton
,
Michael Preuss
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Ruth Loos
,
Susan Gundell
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Peggy Wan
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James Mohler
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Elizabeth Fontham
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Gary Smith
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Jack Taylor
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Shiv Srivastava
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Rosaline Eeles
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John Carpten
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Adam Kibel
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Luc Multigner
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Marie-Élise Parent
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Florence Menegaux
(6)
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Geraldine Cancel-Tassin
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Eric Klein
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Caroline Andrews
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Timothy Rebbeck
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Laurent Brureau
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Stefan Ambs
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Todd Edwards
,
Stephen Watya
,
Stephen Chanock
,
John Witte
,
William Blot
,
J. Michael Gaziano
,
Amy Justice
,
David Conti
,
Christopher Haiman
(1, 2)
1
USC -
University of Southern California
2 Keck School of Medicine [Los Angeles]
3 CeRePP - Centre de Recherche pour les Pathologies Prostatiques [Paris]
4 Irset - Institut de recherche en santé, environnement et travail
5 CHU Pointe-à-Pitre / Abymes [Guadeloupe]
6 CESP - Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations
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4 Irset - Institut de recherche en santé, environnement et travail
5 CHU Pointe-à-Pitre / Abymes [Guadeloupe]
6 CESP - Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations
Ravi Madduri
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Alex Rodriguez
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Burcu Darst
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- PersonId : 1329382
- ORCID : 0000-0002-0552-4642
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Christopher Haiman
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Résumé
Background - Genetic factors play an important role in prostate cancer (PCa) susceptibility. Objective - To discover common genetic variants contributing to the risk of PCa in men of African ancestry. Design, setting, and participants - We conducted a meta-analysis of ten genome-wide association studies consisting of 19378 cases and 61620 controls of African ancestry. Outcome measurements and statistical analysis - Common genotyped and imputed variants were tested for their association with PCa risk. Novel susceptibility loci were identified and incorporated into a multiancestry polygenic risk score (PRS). The PRS was evaluated for associations with PCa risk and disease aggressiveness. Results and limitations - Nine novel susceptibility loci for PCa were identified, of which seven were only found or substantially more common in men of African ancestry, including an African-specific stop-gain variant in the prostate-specific gene anoctamin 7 (ANO7). A multiancestry PRS of 278 risk variants conferred strong associations with PCa risk in African ancestry studies (odds ratios [ORs] >3 and >5 for men in the top PRS decile and percentile, respectively). More importantly, compared with men in the 40-60% PRS category, men in the top PRS decile had a significantly higher risk of aggressive PCa (OR = 1.23, 95% confidence interval = 1.10-1.38, p = 4.4 × 10). Conclusions - This study demonstrates the importance of large-scale genetic studies in men of African ancestry for a better understanding of PCa susceptibility in this high-risk population and suggests a potential clinical utility of PRS in differentiating between the risks of developing aggressive and nonaggressive disease in men of African ancestry. Patient summary - In this large genetic study in men of African ancestry, we discovered nine novel prostate cancer (PCa) risk variants. We also showed that a multiancestry polygenic risk score was effective in stratifying PCa risk, and was able to differentiate risk of aggressive and nonaggressive disease.
Origine | Fichiers produits par l'(les) auteur(s) |
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