ISARIC-COVID-19 dataset: A Prospective, Standardized, Global Dataset of Patients Hospitalized with COVID-19 - Université de Rennes
Article Dans Une Revue Scientific Data Année : 2022

ISARIC-COVID-19 dataset: A Prospective, Standardized, Global Dataset of Patients Hospitalized with COVID-19

Ali Abbas , Sheryl Ann Abdukahil , Nurul Najmee Abdulkadir , Ryuzo Abe , Laurent Abel (1) , Lara Absil , Kamal Abu Jabal , Hiba Abu Zayyad , Subhash Acharya , Andrew Acker , Shingo Adachi , Elisabeth Adam , Enrico Adriano , Diana Adrião , Saleh Al Ageel , Shakeel Ahmed , Marina Aiello , Kate Ainscough , Eka Airlangga , Tharwat Aisa , Ali Ait Hssain , Younes Ait Tamlihat , Takako Akimoto , Ernita Akmal , Eman Al Qasim , Tala Al-Dabbous , Abdulrahman Al-Fares , Razi Alalqam , Angela Alberti , Senthilkumar Alegesan , Cynthia Alegre , Marta Alessi , Beatrice Alex , Kévin Alexandre , Huda Alfoudri , Adam Ali , Imran Ali , Naseem Ali Shah , Naseem Ali Sheikh , Kazali Enagnon Alidjnou , Jeffrey Aliudin , Qabas Alkhafajee , Clotilde Allavena , Nathalie Allou , Aneela Altaf , João Alves , João Melo Alves , Rita Alves , Maria Amaral , Nur Amira , Heidi Ammerlaan , Phoebe Ampaw , Roberto Andini , Claire Andrejak , Andrea Angheben , François Angoulvant , Séverine Ansart , Sivanesen Anthonidass , Massimo Antonelli , Carlos Alexandre Antunes de Brito , Kazi Rubayet Anwar , Ardiyan Apriyana , Yaseen Arabi , Irene Aragao , Francisco Arancibia , Carolline Araujo , Antonio Arcadipane , Patrick Archambault , Lukas Arenz , Jean-Benoît Arlet , Christel Arnold-Day , Ana Aroca , Lovkesh Arora , Rakesh Arora , Elise Artaud-Macari , Diptesh Aryal , Motohiro Asaki , Angel Asensio , Elizabeth Ashley , Muhammad Ashraf , Namra Asif , Mohammad Asim , Jean Baptiste Assie , Amirul Asyraf , Anika Atique , A. Attanyake , Johann Auchabie , Hugues Aumaitre , Adrien Auvet , Eyvind Axelsen , Laurène Azemar , Cecile Azoulay , Benjamin Bach , Delphine Bachelet , Claudine Badr , Roar Bævre-Jensen , Nadia Baig , J. Kenneth Baillie , J Kevin Baird , Erica Bak , Agamemnon Bakakos , Nazreen Abu Bakar , Andriy Bal , Mohanaprasanth Balakrishnan , Valeria Balan , Firouzé Bani-Sadr , Renata Barbalho , Nicholas Yuri Barbosa , Wendy Barclay , Saef Umar Barnett , Michaela Barnikel , Helena Barrasa , Audrey Barrelet , Cleide Barrigoto , Marie Bartoli , Cheryl Bartone , Joaquín Baruch , Mustehan Bashir , Romain Basmaci , Muhammad Fadhli Hassin Basri , Denise Battaglini , Jules Bauer , Diego Fernando Bautista Rincon , Denisse Bazan Dow , Abigail Beane , Alexandra Bedossa , Ker Hong Bee , Husna Begum , Sylvie Behilill , Karine Beiruti , Albertus Beishuizen , Aleksandr Beljantsev , David Bellemare , Anna Beltrame , Beatriz Amorim Beltrão , Marine Beluze , Nicolas Benech , Lionel Eric Benjiman , Dehbia Benkerrou , Suzanne Bennett , Luís Bento , Jan-Erik Berdal , Delphine Bergeaud , Hazel Bergin , José Luis Bernal Sobrino , Giulia Bertoli , Lorenzo Bertolino , Simon Bessis , Adam Betz , Sybille Bevilcaqua , Karine Bezulier , Amar Bhatt , Krishna Bhavsar , Isabella Bianchi , Claudia Bianco , Farah Nadiah Bidin , Moirangthem Bikram Singh , Felwa Bin Humaid , Mohd Nazlin Bin Kamarudin , François Bissuel , Patrick Biston , Laurent Bitker , Jonathan Bitton , Pablo Blanco-Schweizer , Catherine Blier , Frank Bloos , Mathieu Blot , Lucille Blumberg , Filomena Boccia , Laetitia Bodenes , Alice Bogaarts , Debby Bogaert , Anne-Hélène Boivin , Pierre-Adrien Bolze , François Bompart , Patrizia Bonelli , Aurelius Bonfasius , Diogo Borges , Raphaël Borie , Hans Martin Bosse , Elisabeth Botelho-Nevers , Lila Bouadma , Olivier Bouchaud , Sabelline Bouchez , Dounia Bouhmani , Damien Bouhour , Kévin Bouiller , Laurence Bouillet , Camile Bouisse , Thipsavanh Bounphiengsy , Latsaniphone Bountthasavong , Anne-Sophie Boureau , John Bourke , Maude Bouscambert , Aurore Bousquet , Jason Bouziotis , Bianca Boxma , Marielle Boyer-Besseyre , Maria Boylan , Fernando Augusto Bozza , Axelle Braconnier , Cynthia Braga , Timo Brandenburger , Filipa Brás Monteiro , Luca Brazzi , Dorothy Breen , Patrick Breen , Kathy Brickell , Alex Browne , Shaunagh Browne , Nicolas Brozzi , Sonja Hjellegjerde Brunvoll , Marjolein Brusse-Keizer , Nina Buchtele , Christian Buesaquillo , Polina Bugaeva , Marielle Buisson , Danilo Buonsenso , Erlina Burhan , Aidan Burrell , Ingrid Bustos , Denis Butnaru , André Cabie , Susana Cabral , Eder Caceres , Cyril Cadoz , Mia Callahan , Kate Calligy , Jose Andres Calvache , Caterina Caminiti , João Camões , Valentine Campana , Paul Campbell , Josie Campisi , Cecilia Canepa , Mireia Cantero , Pauline Caraux-Paz , Sheila Cárcel , Chiara Simona Cardellino , Filipa Cardoso , Filipe Cardoso , Nelson Cardoso , Sofia Cardoso , Simone Carelli , Francesca Carlacci , Nicolas Carlier , Thierry Carmoi , Gayle Carney , Inês Carqueja , Marie-Christine Carret , François Martin Carrier , Ida Carroll , Gail Carson , Leonor Carvalho , Maire-Laure Casanova , Mariana Cascão , Siobhan Casey , José Casimiro , Bailey Cassandra , Silvia Castañeda , Nidyanara Castanheira , Guylaine Castor-Alexandre , Henry Castrillón , Ivo Castro , Ana Catarino , François-Xavier Catherine , Paolo Cattaneo , Roberta Cavalin , Giulio Giovanni Cavalli , Alexandros Cavayas , Adrian Ceccato , Minerva Cervantes-Gonzalez , Anissa Chair , Catherine Chakveatze , Adrienne Chan , Meera Chand , Christelle Chantalat Auger , Jean-Marc Chapplain , Julie Chas , Allegra Chatterjee , Mobin Chaudry , Jonathan Samuel Chávez Iñiguez , Anjellica Chen , Yih-Sharng Chen , Matthew Pellan Cheng , Antoine Cheret , Alfredo Antonio Chetta , Thibault Chiarabini , Julian Chica , Suresh Kumar Chidambaram , Leong Chin Tho , Catherine Chirouze , Davide Chiumello , Hwa Jin Cho , Sung-Min Cho , Bernard Cholley , Danoy Chommanam , Marie-Charlotte Chopin , Ting Soo Chow , Yock Ping Chow , Nathaniel Christy , Hiu Jian Chua , Jonathan Chua , Jose Pedro Cidade , José Miguel Cisneros Herreros , Barbara Wanjiru Citarella , Anna Ciullo , Emma Clarke , Jennifer Clarke , Rolando Claure-Del Granado , Sara Clohisey , Perren Cobb , Cassidy Codan , Caitriona Cody , Alexandra Coelho , Megan Coles , Gwenhaël Colin , Michael Collins , Sebastiano Maria Colombo , Pamela Combs , Marie Connor , Anne Conrad , Sofía Contreras , Elaine Conway , Graham Cooke , Mary Copland , Hugues Cordel , Amanda Corley , Sabine Cornelis , Alexander Daniel Cornet , Arianne Joy Corpuz , Andrea Cortegiani , Grégory Corvaisier , Emma Costigan , Camille Couffignal , Sandrine Couffin-Cadiergues , Roxane Courtois , Stéphanie Cousse , Rachel Cregan , Charles Crepy D’orleans , Sabine Croonen , Gloria Crowl , Jonathan Crump , Claudina Cruz , Juan Luis Cruz Berm , Jaime Cruz Rojo , Marc Csete , Alberto Cucino , Ailbhe Cullen , Matthew Cummings , Ger Curley , Gerard Curley , Elodie Curlier , Colleen Curran , Paula Custodio , Federico D’amico , Frédérick D’aragon , Eric D’ortenzio , Ana da Silva Filipe , Charlene da Silveira , Al-Awwab Dabaliz , Andrew Dagens , John Arne Dahl , Darren Dahly , Heidi Dalton , Jo Dalton , Seamus Daly , Nick Daneman , Corinne Daniel , Emmanuelle Dankwa , Jorge Dantas , Mark de Boer , Gillian de Loughry , Diego de Mendoza , Etienne de Montmollin , Rafael Freitas de Oliveira França , Ana Isabel de Pinho Oliveira , Rosanna de Rosa , Cristina de Rose , Thushan de Silva , Peter de Vries , Jillian Deacon , David Dean , Alexa Debard (2) , Bianca Debenedictis , Marie-Pierre Debray , Nathalie Decastro , William Dechert , Lauren Deconninck , Romain Decours , Eve Defous , Isabelle Delacroix , Eric Delaveuve , Karen Delavigne (3) , Nathalie Delfos , Ionna Deligiannis , Andrea Dell’amore , Christelle Delmas , Pierre Delobel (4) , Corine Delsing , Elisa Demonchy , Emmanuelle Denis , Dominique Deplanque , Pieter Depuydt , Mehul Desai , Diane Descamps , Mathilde Desvallées , Santi Dewayanti , Pathik Dhanger , Alpha Diallo , Sylvain Diamantis , André Dias , Andrea Dias , Juan Jose Diaz , Priscila Diaz , Rodrigo Diaz , Kévin Didier , Jean-Luc Diehl , Wim Dieperink , Jérôme Dimet , Vincent Dinot , Fara Diop , Alphonsine Diouf , Yael Dishon , Félix Djossou , Annemarie Docherty , Helen Doherty , Arjen Dondorp , Andy Dong , Christl Donnelly , Maria Donnelly , Chloe Donohue , Sean Donohue , Yoann Donohue , Peter Doran , Céline Dorival , Phouvieng Douangdala , James Joshua Douglas , Renee Douma , Nathalie Dournon , Triona Downer , Joanne Downey , Mark Downing , Tom Drake , Aoife Driscoll , Amiel Dror , Murray Dryden , Claudio Duarte Fonseca , Vincent Dubee , François Dubos , Audrey Dubot-Pérès , Alexandre Ducancelle , Toni Duculan , Susanne Dudman , Abhijit Duggal , Paul Dunand , Jake Dunning , Mathilde Duplaix , Emanuele Durante-Mangoni , Lucian Durham , Bertrand Dussol , Juliette Duthoit , Xavier Duval , Anne Margarita Dyrhol-Riise , Sim Choon Ean , Marco Echeverria-Villalobos , Giorgio Economopoulos , Michael Edelstein , Siobhan Egan , Linn Margrete Eggesbø , Carla Eira , Mohammed El Sanharawi , Subbarao Elapavaluru , Brigitte Elharrar , Jacobien Ellerbroek , Merete Ellingjord-Dale , Philippine Eloy , Tarek Elshazly , Iqbal Elyazar , Isabelle Enderle , Tomoyuki Endo , Chan Chee Eng , Ilka Engelmann , Vincent Enouf , Olivier Epaulard , Martina Escher , Mariano Esperatti , Hélène Esperou , Marina Esposito-Farese , João Estevão , Manuel Etienne , Nadia Ettalhaoui , Anna Greti Everding , Mirjam Evers , Isabelle Fabre , Marc Fabre , Amna Faheem , Arabella Fahy , Cameron Fairfield , Zul Fakar , Komal Fareed , Pedro Faria , Ahmed Farooq , Hanan Fateena , Arie Zainul Fatoni , Karine Faure , Raphaël Favory , Mohamed Fayed , Niamh Feely , Laura Feeney , Jorge Fernandes , Marília Andreia Fernandes , Susana Fernandes , François-Xavier Ferrand , Eglantine Ferrand Devouge , Joana Ferrão , Carlo Ferrari , Mário Ferraz , Benigno Ferreira , Isabel Ferreira , Sílvia Ferreira , Ricard Ferrer-Roca , Nicolas Ferriere , Céline Ficko , Claudia Figueiredo-Mello , William Finlayson , Juan Fiorda , Thomas Flament , Clara Flateau , Tom Fletcher , Letizia Lucia Florio , Brigid Flynn , Deirdre Flynn , Federica Fogliazza , Claire Foley , Jean Foley , Victor Fomin , Tatiana Fonseca , Patricia Fontela , Simon Forsyth , Denise Foster , Giuseppe Foti , Erwan Fourn , Robert Fowler , Marianne Fraher , Diego Franch-Llasat , Christophe Fraser , John Fraser , Marcela Vieira Freire , Ana Freitas Ribeiro , Craig French , Caren Friedrich , Ricardo Fritz , Stéphanie Fry , Nora Fuentes , Masahiro Fukuda , G Argin , Valérie Gaborieau , Rostane Gaci , Massimo Gagliardi , Jean-Charles Gagnard , Nathalie Gagné , Amandine Gagneux-Brunon , Sérgio Gaião , Linda Gail Skeie , Phil Gallagher , Elena Gallego Curto , Carrol Gamble , Yasmin Gani , Arthur Garan , Rebekha Garcia , Noelia García Barrio , Julia Garcia-Diaz , Esteban Garcia-Gallo , Navya Garimella , Federica Garofalo , Denis Garot , Valérie Garrait , Basanta Gauli , Nathalie Gault , Aisling Gavin , Anatoliy Gavrylov , Alexandre Gaymard , Johannes Gebauer , Eva Geraud , 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Mathew , Daniel Mathieu , Mathieu Mattei , Romans Matulevics , Laurence Maulin , Michael Maxwell , Javier Maynar , Mayfong Mayxay , Thierry Mazzoni , Natalie Mc Evoy , Lisa Mc Sweeney , Colin Mcarthur , Aine Mccarthy , Anne Mccarthy , Colin Mccloskey , Rachael Mcconnochie , Sherry Mcdermott , Sarah Mcdonald , Aine Mcelroy , Samuel Mcelwee , Victoria Mceneany , Allison Mcgeer , Chris Mckay , Johnny Mckeown , Kenneth Mclean , Paul Mcnally , Bairbre Mcnicholas , Elaine Mcpartlan , Edel Meaney , Cécile Mear-Passard , Maggie Mechlin , Maqsood Meher , Omar Mehkri , Ferruccio Mele , Luis Melo , Kashif Memon , Joao Mendes , Ogechukwu Menkiti , Kusum Menon , France Mentré , Alexander Mentzer , Emmanuelle Mercier , Noémie Mercier , Antoine Merckx , Mayka Mergeay-Fabre , Blake Mergler , Laura Merson , Tiziana Meschi , António Mesquita , Roberta Meta , Osama Metwally , Agnès Meybeck , Dan Meyer , Alison Meynert , Vanina Meysonnier , Amina Meziane , Mehdi Mezidi , Giuliano Michelagnoli , Céline 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The International Severe Acute Respiratory and Emerging Infection Consortium (ISARIC) COVID-19 dataset is one of the largest international databases of prospectively collected clinical data on people hospitalized with COVID-19. This dataset was compiled during the COVID-19 pandemic by a network of hospitals that collect data using the ISARIC-World Health Organization Clinical Characterization Protocol and data tools. The database includes data from more than 705,000 patients, collected in more than 60 countries and 1,500 centres worldwide. Patient data are available from acute hospital admissions with COVID-19 and outpatient follow-ups. The data include signs and symptoms, pre-existing comorbidities, vital signs, chronic and acute treatments, complications, dates of hospitalization and discharge, mortality, viral strains, vaccination status, and other data. Here, we present the dataset characteristics, explain its architecture and how to gain access, and provide tools to facilitate its use.
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hal-03830494 , version 1 (23-01-2023)

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Citer

Ali Abbas, Sheryl Ann Abdukahil, Nurul Najmee Abdulkadir, Ryuzo Abe, Laurent Abel, et al.. ISARIC-COVID-19 dataset: A Prospective, Standardized, Global Dataset of Patients Hospitalized with COVID-19. Scientific Data , 2022, 9 (1), pp.454. ⟨10.1038/s41597-022-01534-9⟩. ⟨hal-03830494⟩
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