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16 Results
authFullName_s : Sophie Coudouel
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Unraveling the Stratification of an Iron-Oxidizing Microbial Mat by Metatranscriptomics

Achim Quaiser , Xavier Bodi , Alexis Dufresne , Delphine Naquin , Andre-Jean Francez et al.
PLoS ONE, 2014, 9 (7), pp.e102561. ⟨10.1371/journal.pone.0102561⟩
Journal articles insu-01060225v1

Reconstruction et évolution du génome chloroplastique des lupins

Guillaume Martin , Oscar Lima , Sophie Coudouel , Delphine Naquin , Armel Salmon et al.
Colloque « Biodiversité, Histoire des Espèces, Evolution des Génomes », Jun 2011, Rennes, France
Conference papers hal-01109584v1

La structure de la communauté fongique associée à un individu plante est-elle déterminée par ses voisins et à quelle échelle spatio-temporelle ?

Anne‐kristel Bittebière , Cendrine Mony , Elodie Maluenda , Agnès Gareil , Alexandra Dheilly et al.
10ème Congrès francophone d’Ecologie des communautés végétales ECOVEG 10, Apr 2014, Lyon, France
Conference poster hal-01090585v1

Patterns of viral and microbial diversity in Sphagnum-dominated peatland using meta genomics

Flore Ballaud , Alexis Dufresne , Andre-Jean Francez , Jonathan Colombet , Télesphore Sime-Ngando et al.
VIème Colloque AFEM “Microbiologie environnementale : du gène à l’écosystème”, Association Francophone d’Ecologie Microbienne, Oct 2013, Clermont-Ferrand, France
Conference papers hal-01156599v1

The complete chloroplast genome of Spartina maritima: Insights from comparative analyses in the Poaceae family and molecular dating between polyploidy lineages

Mathieu Rousseau-Gueutin , Sidonie Bellot , Guillaume Martin , Julien Boutte , Houda Chelaifa et al.
International Conference on Invasive Spartina 2014, Jul 2014, Rennes, France
Conference poster hal-01109677v1

Genome and transcriptome analyses in hexaploid Spartina species (Poaceae) colonizing salt marshes

Julie Ferreira de Carvalho , Julie Poulain , Corinne da Silva , Patrick Wincker , Sophie Coudouel et al.
PAG XIX Plant and Animal Genome Conference, Jan 2012, San Diego, United States
Conference poster hal-01110212v1

Is the diversity of the active plant root microbiome spatially structured?

Amandine Lê Van , Achim Quaiser , Philippe Vandenkoornhuyse , Alexandra Dheilly , Sophie Coudouel et al.
Colloque Génomique Environnementale ‘Diversité, évolution et fonctionnement du vivant à l’ère des nouvelles technologies de séquençage’, Aug 2013, Rennes, France
Conference poster hal-01159027v1
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Past spatial structure of plant communities determines arbuscular mycorrhizal fungal community assembly

Anne‐kristel Bittebière , Philippe Vandenkoornhuyse , Elodie Maluenda , Agnès Gareil , Alexandra Dheilly et al.
Journal of Ecology, 2020, 108 (2), pp.546-560. ⟨10.1111/1365-2745.13279⟩
Journal articles hal-02328020v1

Vers la caractérisation des compartiments codant et répété du génome des spartines polyploïdes par séquençage en masse

Julie Ferreira de Carvalho , Houda Chelaifa , Jiri Macas , Oscar Lima , Sophie Coudouel et al.
Colloque « Biodiversité, Histoire des Espèces, Evolution des Génomes », Jun 2011, Rennes, France
Conference papers hal-01108953v1

Automatized detection of duplicated copies from NGS data: Application to 45S rDNA and coding genes in the hexaploid Spartina maritime (Poaceae)

Julien Boutte , Benoit Aliaga , Julie Ferreira de Carvalho , Oscar Lima , Sophie Coudouel et al.
Rencontres ALPHY/PhyloSIB, Feb 2013, Lyon, France
Conference papers hal-01108442v1

Ecological genomics of invasive polyploids: Case study from hexaploid and allo-dodecaploid Spartina species colonizing salt marshes

Julie Ferreira de Carvalho , Julie Poulain , Corinne da Silva , Patrick Wincker , Sophie Coudouel et al.
International Conference of Ployploidy, Hybridization and Biodiversity (ICPHB), May 2012, Pruhonice, Czech Republic
Conference papers hal-01108907v1

Evolution de la taille des génomes et diversification des lupins

Abdelkader Aïnouche , Frédéric Mahé , Guillaume Martin , Virginie Huteau , Olivier Coriton et al.
Colloque « Biodiversité, Histoire des Espèces, Evolution des Génomes », Jun 2011, Rennes, France
Conference papers hal-01108938v1
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The influence of host-plant connectivity on fungal assemblages in the root microbiota of Brachypodium pinnatum

Cendrine Mony , Nathan Vannier , Philomène Brunellière , Marine Biget , Sophie Coudouel et al.
Ecology, 2020, 101 (4), pp.e02976. ⟨10.1002/ecy.2976⟩
Journal articles hal-02470909v1

Viral and microbial diversity in a Sphagnum-dominated peatland using metagenomics

Flore Ballaud , Alexis Dufresne , Andre-Jean Francez , Jonathan Colombet , Télesphore Sime-Ngando et al.
Colloque Génomique Environnementale ‘Diversité, évolution et fonctionnement du vivant à l’ère des nouvelles technologies de séquençage’, Aug 2013, Rennes, France
Conference poster hal-01159031v1

Automatized detection of duplicated copies from NGS data: Application to 45S rDNA and coding genes in hexaploid Spartina species (Poaceae)

Julien Boutte , Benoit Aliaga , Julie Ferreira de Carvalho , Oscar Lima , Sophie Coudouel et al.
International Conference of Ployploidy, Hybridization and Biodiversity (ICPHB), May 2012, Prague, Czech Republic
Conference poster hal-01110201v1

Environmental genomics of phototrophic fluctuations in a freshwater ecosystem: Preliminary analysis of taxonomic diversity in metagenomics datasets

Gwenola Gouesbet , Sophie Coudouel , Delphine Naquin , Oscar Lima , Marion Lengronne et al.
Colloque de restitution du programme EC2CO 2010, Nov 2010, Toulouse, France
Conference papers hal-01158629v1