Unraveling the Stratification of an Iron-Oxidizing Microbial Mat by Metatranscriptomics
Achim Quaiser
,
Xavier Bodi
,
Alexis Dufresne
,
Delphine Naquin
,
Andre-Jean Francez
et al.
Journal articles
insu-01060225v1
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Reconstruction et évolution du génome chloroplastique des lupins
Guillaume Martin
,
Oscar Lima
,
Sophie Coudouel
,
Delphine Naquin
,
Armel Salmon
et al.
Colloque « Biodiversité, Histoire des Espèces, Evolution des Génomes » , Jun 2011, Rennes, France
Conference papers
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La structure de la communauté fongique associée à un individu plante est-elle déterminée par ses voisins et à quelle échelle spatio-temporelle ?
Anne‐kristel Bittebière
,
Cendrine Mony
,
Elodie Maluenda
,
Agnès Gareil
,
Alexandra Dheilly
et al.
10ème Congrès francophone d’Ecologie des communautés végétales ECOVEG 10 , Apr 2014, Lyon, France
Conference poster
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Patterns of viral and microbial diversity in Sphagnum-dominated peatland using meta genomics
Flore Ballaud
,
Alexis Dufresne
,
Andre-Jean Francez
,
Jonathan Colombet
,
Télesphore Sime-Ngando
et al.
VIème Colloque AFEM “Microbiologie environnementale : du gène à l’écosystème” , Association Francophone d’Ecologie Microbienne, Oct 2013, Clermont-Ferrand, France
Conference papers
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The complete chloroplast genome of Spartina maritima: Insights from comparative analyses in the Poaceae family and molecular dating between polyploidy lineages
Mathieu Rousseau-Gueutin
,
Sidonie Bellot
,
Guillaume Martin
,
Julien Boutte
,
Houda Chelaifa
et al.
International Conference on Invasive Spartina 2014 , Jul 2014, Rennes, France
Conference poster
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Genome and transcriptome analyses in hexaploid Spartina species (Poaceae) colonizing salt marshes
Julie Ferreira de Carvalho
,
Julie Poulain
,
Corinne da Silva
,
Patrick Wincker
,
Sophie Coudouel
et al.
PAG XIX Plant and Animal Genome Conference , Jan 2012, San Diego, United States
Conference poster
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Is the diversity of the active plant root microbiome spatially structured?
Amandine Lê Van
,
Achim Quaiser
,
Philippe Vandenkoornhuyse
,
Alexandra Dheilly
,
Sophie Coudouel
et al.
Colloque Génomique Environnementale ‘Diversité, évolution et fonctionnement du vivant à l’ère des nouvelles technologies de séquençage’ , Aug 2013, Rennes, France
Conference poster
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Past spatial structure of plant communities determines arbuscular mycorrhizal fungal community assembly
Anne‐kristel Bittebière
,
Philippe Vandenkoornhuyse
,
Elodie Maluenda
,
Agnès Gareil
,
Alexandra Dheilly
et al.
Journal articles
hal-02328020v1
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Vers la caractérisation des compartiments codant et répété du génome des spartines polyploïdes par séquençage en masse
Julie Ferreira de Carvalho
,
Houda Chelaifa
,
Jiri Macas
,
Oscar Lima
,
Sophie Coudouel
et al.
Colloque « Biodiversité, Histoire des Espèces, Evolution des Génomes » , Jun 2011, Rennes, France
Conference papers
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Automatized detection of duplicated copies from NGS data: Application to 45S rDNA and coding genes in the hexaploid Spartina maritime (Poaceae)
Julien Boutte
,
Benoit Aliaga
,
Julie Ferreira de Carvalho
,
Oscar Lima
,
Sophie Coudouel
et al.
Rencontres ALPHY/PhyloSIB , Feb 2013, Lyon, France
Conference papers
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Ecological genomics of invasive polyploids: Case study from hexaploid and allo-dodecaploid Spartina species colonizing salt marshes
Julie Ferreira de Carvalho
,
Julie Poulain
,
Corinne da Silva
,
Patrick Wincker
,
Sophie Coudouel
et al.
International Conference of Ployploidy, Hybridization and Biodiversity (ICPHB) , May 2012, Pruhonice, Czech Republic
Conference papers
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Evolution de la taille des génomes et diversification des lupins
Abdelkader Aïnouche
,
Frédéric Mahé
,
Guillaume Martin
,
Virginie Huteau
,
Olivier Coriton
et al.
Colloque « Biodiversité, Histoire des Espèces, Evolution des Génomes » , Jun 2011, Rennes, France
Conference papers
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The influence of host-plant connectivity on fungal assemblages in the root microbiota of Brachypodium pinnatum
Cendrine Mony
,
Nathan Vannier
,
Philomène Brunellière
,
Marine Biget
,
Sophie Coudouel
et al.
Journal articles
hal-02470909v1
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Viral and microbial diversity in a Sphagnum-dominated peatland using metagenomics
Flore Ballaud
,
Alexis Dufresne
,
Andre-Jean Francez
,
Jonathan Colombet
,
Télesphore Sime-Ngando
et al.
Colloque Génomique Environnementale ‘Diversité, évolution et fonctionnement du vivant à l’ère des nouvelles technologies de séquençage’ , Aug 2013, Rennes, France
Conference poster
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Automatized detection of duplicated copies from NGS data: Application to 45S rDNA and coding genes in hexaploid Spartina species (Poaceae)
Julien Boutte
,
Benoit Aliaga
,
Julie Ferreira de Carvalho
,
Oscar Lima
,
Sophie Coudouel
et al.
International Conference of Ployploidy, Hybridization and Biodiversity (ICPHB) , May 2012, Prague, Czech Republic
Conference poster
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Environmental genomics of phototrophic fluctuations in a freshwater ecosystem: Preliminary analysis of taxonomic diversity in metagenomics datasets
Gwenola Gouesbet
,
Sophie Coudouel
,
Delphine Naquin
,
Oscar Lima
,
Marion Lengronne
et al.
Colloque de restitution du programme EC2CO 2010 , Nov 2010, Toulouse, France
Conference papers
hal-01158629v1
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